广西科学院学报

2014, v.30;No.106(04) 294-298

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α-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的定量预测
Quantitative Predicting Kcat of α-amylase Amy 7C and Its Mutants

黄纪民;师德强;严少敏;吴光;谢能中;龙思宇;李检秀;黄艳燕;

摘要(Abstract):

【目的】利用α-淀粉酶Amy7c及其突变体的氨基酸信息,预测该酶的催化常数(Kcat),并筛选出能预测α-淀粉酶Kcat最具效果的氨基酸属性。【方法】先以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的拟合。再将α-淀粉酶Amy7C及其54个突变体的数据分为2组,用35个酶作为训练组进行拟合,20个酶作为验证组进行检验。最后,对8种不同层次及神经元个数的模型进行比较。【结果】110个氨基酸属性可实现20-1神经网络模型收敛,表明这些氨基酸属性可用于预测α-淀粉酶的催化常数,不同指标的预测效果不同。多模型的分析结果显示,不同模型对训练组R值的结果具有显著性差异,而对训练组P值、验证组R值和验证组P值结果无显著性差异。【结论】氨基酸分布概率等属性可以用于预测α-淀粉酶催化常数。四层神经网络模型是预测α-淀粉酶催化常数的相对理想的模型。

关键词(KeyWords): 氨基酸属性;α-淀粉酶;催化常数;预测

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 广西自然科学基金重点项目(2013GXNSFDA019007);; 广西科技创新能力与条件建设计划项目(桂科能12237022);; 广西人才小高地建设专项基金项目资助

作者(Author): 黄纪民;师德强;严少敏;吴光;谢能中;龙思宇;李检秀;黄艳燕;

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