广西科学院学报

2014, v.30;No.106(04) 289-293

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流感病毒M2质子通道抑制机理的计算化学模拟和理论分析
Theoretical Study and Computational Chemistry Modeling for the Inhibition Mechanism of M2 Proton Channel in Influenza A Virus

秦艳;谢能中;杜奇石;黄日波;

摘要(Abstract):

【背景】A型流感病毒的M2质子通道蛋白的X-ray和NMR结构已于2008年测定,并成为发展抗流感的重要药物靶标,但学术界对于抑制剂的作用机理尚有争论。【方法】用SYBYL软件作M2通道蛋白与金刚烷胺抑制剂的对接计算,在可能的对接位点(Asp-44,Trp-41,His-37)上用精确的量子化学方法计算对接能,并根据结构化学和物理化学的原理分析抑制剂的作用机理。【结果】计算了金刚烷胺与M2质子通道的多个可能的结合位点的结合能,包括His-37,Trp-41和Asp-44。【结论】金刚烷胺对M2的抑制是一个动态过程,可能有多个位点结合。金刚烷胺穿透细胞膜后在通道出口与Asp-44形成盐桥,质子流使盐桥解离,金刚烷胺再进入通道与芳香氨基酸Trp-41(或His-37)形成阳离子-键。

关键词(KeyWords): 流感病毒;金刚烷;M2质子通道;抑制机理

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31370716和31360207)资助

作者(Author): 秦艳;谢能中;杜奇石;黄日波;

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